AG Geomikrobiologie

In unserer Arbeitsgruppe Geomikrobiologie untersuchen wir, wie Mikroorganismen ihre Umwelt gestalten – mit einem besonderen Fokus auf schwefeloxidierende Bakterien, die durch außergewöhnliche physiologische Anpassungen sehr spezielle Nischen besetzen. Dazu gehören zum Beispiel besonders große Schwefelbakterien der Familie der Beggiatoaceae, hochbewegliche magnetotaktische Bakterien der Gattung Magnetococcus oder manganreduzierende Schwefeloxidierer der Gattung Sulfurimonas.

Geografisch arbeiten wir vor allem in den beiden größten Brackwassermeeren der Erde – der Ostsee und dem Schwarzen Meer – sowie in marinen Sedimenten von Auftriebsgebieten, küstennahen Sanden und Schlicken. Unsere interessieren insbesondere oxisch–anoxische Grenzschichten, sowohl im Pelagial als auch im Benthal, an denen diese Mikroorganismen leben und zentrale biogeochemische Prozesse steuern. Dabei betrachten wir ihre Rolle in den Kreisläufen von Schwefel, Stickstoff und Phosphor.

Wir verbinden Feldarbeit und Laborstudien: Im Labor reichern wir Mikroorganismen an, isolieren und kultivieren sie und führen gezielte Experimente durch, um ihre Physiologie und ihr Wechselspiel mit der Umwelt zu verstehen. Mit Mikrosensoren und Nährstoffanalyzern erfassen wir die feinen chemischen Gradienten, in denen sich diese Organismen aufhalten. Ergänzend nutzen wir Mikroskopie sowie ein breites Spektrum molekularer Methoden – von der Genomsequenzierung von Anreicherungen und Isolaten bis hin zu Metabarcoding und Meta-Omics von Labor- und Feldproben. So schlagen wir die Brücke von der einzelnen Zelle bis hin zu großskaligen Stoffflüssen in marinen Ökosystemen.